ЗАО НИИ ЦПС является крупным разработчиком информационных систем, осуществляющим полный цикл исследований, проектирования, разработки и внедрения крупных информационных систем с 1971 года. Основными видами деятельности ЗАО НИИ ЦПС являются:

 

• Разработка и проектирование тренажеров и обучающих систем
• Разработка автоматизированных систем управления техническим обеспечением
• Автоматизация морской спасательной деятельности
• Автоматизация научных исследований
• Информационные системы автоматизации организационного управления жизненным циклом сложных технических комплексов
• Моделирование сложных технических объектов
• Научные исследования и разработки в области распределённых информационных систем: многоагентные системы, информационные пространства, открытые системы
• Информационная безопастность
• Разработка и производство аппаратно-программных средств защиты информации от несанкционированного доступа (НСД)
• Защита гостайны: осуществление специальных проверок техники на сертифицированном и аккредитованном оборудовании
• Защита персональных данных 
• Производство и поставки компьютеров в защищенном исполнении 
•  Издательская деятельность: издание книг и международного журнала "Программные продукты и системы"